PandemiX – Center for Interdisciplinary Study of Pandemic Signatures – is a Center of Excellence funded by The Danish National Research Foundation (DNRF). We are an interdisciplinary research center that studies pandemics in all their inherent complexity. The Center’s overall research objective is to investigate the signature features of COVID-19 and pandemics of the past, to better understand both and to better prepare for future pandemics.
Pandemics have afflicted humanity throughout recorded history. When new diseases emerged, acquired immunity in the human population and evolutionary changes in the pathogens brought the ensuing pandemics to an end. As scientific tools to understand and reduce the harms from pandemics have improved, the study of pandemics has expanded from history and demography to also encompass quantitative research in fields such as population biology and applied mathematics.
PandemiX unites studies of the historical and contemporary record of experienced pandemics in a radically interdisciplinary environment. By taking such a wide view, we strive to make breakthroughs not hitherto possible or attempted, ranging from a profound understanding of how to control transmission in the short run, to how best to secure robust population immunity in decades to come. The PandemiX Center will give rise to a new field, pandemiology, home to a growing cadre of interdisciplinary researchers ready to address the inevitable next pandemic.
Roskilde University (RUC) Department of Science and Environment (DSE), is the host institution of the PandemiX Center. Furthermore, PandemiX has an office suite at Statens Serum Institute (SSI).
Målet med PandemiX er at opbygge en omfattende forståelse af de kræfter, der former pandemier fra de opstår til de dør ud og beskrive og kvantificere kendetegn ved pandemier i nutid og fortid.
Vi har organiseret vores forskning i seks forbundne forskningsprogrammer. Tilsammen vil disse programmer behandle alle aspekter af hele pandemiens cyklus. Alle seks programmer kræver to eller flere af vores anførte kernekompetencer, og på tværs af programmerne vil der være et indgående samarbejde mellem forskerne.
PandemiX Centret deltager i en række forskningsprojekter, som er både internt og eksternt finansieret, ligesom centrets forskere deltager i projekter i samarbejde med andre forskningsinstitutioner i Danmark og udlandet.
I PandemiX centeret på Roskilde Universitet, arbejder en bred vifte af forskere fra forskellige områder sammen, med det mål at forstå historiske epidemier og være bedre forberedt på fremtidige sygdomme. Forskerne har også udarbejdet en række undervisningsmaterialer, som frit kan benyttes.
Forskerne har udarbejdet en undervisningspakke til gymnasier, hvor du kan lære, hvordan matematiske modeller kan bruges til både at forstå historiske data og til at forudsige udviklingen af en pandemi som COVID-19.
Materialet er udviklet i samarbejde mellem forskere fra RUC og lærere fra STX og HTX således, at det er den nyeste forskning, der ligger til grund - og så det passer ind i læreplanen for matematik.
Se undervisningspakken Epidemier og matematiske modeller
I sommeren 1918 kom den spanske syge til Danmark. Det resulterede i tre større udbrud: Ét stort udbrud om sommeren, ét endnu større udbrud sent på efteråret, og en længere periode hen over vinteren med mange smittetilfælde.
I dette undervisningsmateriale har forskerne samlet en række data fra København, hvor man kan se den spanske syges udvikling og selv arbejde med data.
Se undervisningsmateriale om Den spanske syge i København
Data- og modelstudie af årsagerne til nedgangen i den globale 2022 mpox epidemi. Datasættet indeholder en kopi af offentlig WHO data med ugentlige mpox tilfælde i 2022, per land. Dertil syntetisk data genereret af TANGO-modellen om seksuel adfærdshistorik for 170.000 simulerede individer (seksuelt netværk) samt simulerede epidemier på det netværk. Kildekoden til TANGO modellen er indeholdt. GitHub UlrikHvid/TANGO model
Dette projekt undersøger konsekvenserne ved person-til-person variabilitet ifht. deltagelse i testprogrammer for smitsomme sygdomme. Projektet benyttede testdata (PCR og antigen) fra Statens Serum Institut. GitHub - NBIBioComplexity/TestHeterogeneity
Vi anvender ofte aggregerede data om indberetning af smitsomme sygdomme i vores forskning (for eksempel: Ingholt et al, 2025, Economic History Review). Disse månedlige data fra hver medicinske region i Danmark er transskriberet fra årlige rapporter fra Det Kongelige Sundhedskollegium for perioden 1867-1904. Du kan udforske dataene i vores interaktiv applikation. Link til Shinyapps
1800-tallet var en tid, hvor sygdomme som kolera, skarlagensfeber og influenza hærgede Danmark. Dengang blev hver eneste begravelse omhyggeligt noteret i de danske kirkebøger. Takket være et stort transkriberingsarbejde af de historiske kirkebøger er dødelighedsdata fra 1814 til 1914 nu tilgængeligt. I vores arbejde i PandemiX har vi analyseret disse 100 års dødsfald og skabt et overblik over 1800-tallets største mortalitetskriser sammen med aggregeret data på amtsniveau. GitHub-SignatureFeatures19thCentury
I forbindelse med vores arbejde på at klarlægge, hvor længe den første koppevaccine gav immunitet mod smitte med kopper, har vi transkriberet data fra hospitalet Søkvæsthuset. Mellem 1824 og 1835 fungerede Søkvæsthuset som koppehospital og karantænestation. Her var det lovpligtigt at indlægge alle med kopper i perioden, og ugelisterne fra Søkvæsthuset giver derfor et godt overblik over en meget stor del af alle koppetilfælde i København på denne tid. Datasættet fra Søkvæsthuset kan findes på Github:
Release Modeling epidemiological patterns of smallpox in Copenhagen in the 19th century after the introduction of the vaccine · basspoder/smallpox_post_honeymoon_phase_1824_1872 · GitHub
For at analysere koppernes spredning, efter at vaccinen blev introduceret, har vi konstrueret en numerisk model, der simulerer vaccineudrulningen og koppeepidemiernes dynamik før, under og efter vaccineudrulningen. Modellen viser, at den aftagende vaccineeffekt med alderen kan forklare, hvorfor kopperne vendte tilbage efter 1824, og hvorfor de gik fra at være en dødelig børnesygdom til en mildere sygdom hos voksne. Koden til denne model (MATLAB) er tilgængelig på Figshare:
https://doi.org/10.6084/m9.figshare.28182581
Data om vaccinationsstatus for danske børn i 1801-35:
Som baggrundsinformation om vaccinationsdækningen benyttede vi optegnelser over registrerede vaccinationer (navn, alder og vaccinationstidspunkt) i Frederiksborg Amt. Disse og de ovennævnte historiske data blev transskriberet af Søren K. Poder.
PandemiX Center er et mangfoldigt team af eksperter med fire kernekompetencer: matematisk modellering af infektionssygdomme, historisk epidemiologi, klinisk forskning og bioinformatik.
.
PandemiX Center vil fokusere på at opbygge en stærk kvantitativ base med forskere inden for områder som matematisk modellering, historisk epidemiologi, bioinformatik og klinisk forskning. Danmark er et ideelt sted at etablere et sådant center, fordi vi både har historiske sundhedsdata og nutidige registerdata, der giver os mulighed for at studere og forstå både historiske og nutidige pandemier langt dybere end i de fleste andre lande.
Hver uge indsamler vi de vigtigste tendenser og nye udbrud inden for smitsomme sygdomme globalt - og præsenterer det i et kort og overskueligt overblik. Målet? At skabe situational awareness og gøre det nemt for fagfolk, journalister og interesserede at følge med i globale sygdomsudbrud.
Læs løbende Pandemiology Watch under "Nyheder".
Pandemien der gik i sig selv: Et nyt studie fra grundforskningscenteret PandemiX viser, hvordan mpox-udbruddet i 2022 blev slået ned – ikke af vacciner eller immunitet, men gennem oplysning og hurtige adfærdsændringer.
Du kan følge forskningen på grundforskningscentret PandemiX på LinkedIn:
Det danske vaccinationsprogram vækker international interesse, og derfor lagde et TV hold fra CNN vejen forbi PandemiX for at høre mere om den viden og praksis, der ligger bag.
Danmark holdt COVID-19-smitten lav gennem tidlig og målrettet indsats. Nyt studie fremhæver, hvordan strategien gjorde det muligt at undgå fuld lockdown.
Hvordan kan historiske pandemier hjælpe os med at forstå og bekæmpe fremtidens sygdomsudbrud? Det spørgsmål er i centrum i en podcast fra Danmarks Frie Forskningsfond, hvor forskerne Lone Simonsen, Viggo Andreasen og Maarten van Wijhe fra PandemiX Center medvirker.
Research output: Contribution to journal › Journal article › Research › peer-review
Research output: Contribution to journal › Journal article › Research › peer-review
Research output: Contribution to journal › Journal article › Research › peer-review
Simonsen, L. (Speaker)
Activity: Talk or presentation › Lecture and oral contribution
Simonsen, L. (Speaker)
Activity: Talk or presentation › Lecture and oral contribution
Simonsen, L. (Speaker)
Activity: Talk or presentation › Lecture and oral contribution
29/08/2026
1 item of Media coverage
Press/Media: Press / Media
29/08/2026
3 items of Media coverage
Press/Media: Press / Media
Forskningscentret er tilknyttet Institut for Naturvidenskab og Miljø men fysisk placeret på Statens Serum Institut (SSI), Artillerivej 5, 2300 København
Relaterede forskningsenheder: Matematik og Fysik (IMFUFA), Molecular and Medical Biology
Ph.d.-skole: Doctoral School of Science and Environment
Uddannelser og fag: Matematical Bioscience // Molecular Health Science // Naturvidenskabelig Bachelor // International Bachelor in Natural Sciences
Lone Simonsen
Forskningscenterleder, professor
Telefon +45 2342 9503
lonesimo@ruc.dk
Johanne Greibe Andersen
Centerkoordinator
Telefon +45 4674 3980
johannea@ruc.dk
Statens Serum Institut (SSI), Artillerivej 5, 2300 København
